[Решено] Как оставить вывод товаров только в дочерних категориях последнего уровня

Там речь идёт о другом месте в коде. Посмотрите внимательно в каком месте у вас эта строка.
Есть такой фрагмент:

PHP:

            foreach ($results as $result) {
                $data = array(
                    'filter_category_id'  => $result['category_id'],
                    'filter_sub_category' => true
                );
               
                $product_total = $this->model_catalog_product->getTotalProducts($data);               
               
                $this->data['categories'][] = array(
                    'name'  => $result['name'] . ($this->config->get('config_product_count') ? ' (' . $product_total . ')' : ''),
                    'href'  => $this->url->link('product/category', 'path=' . $this->request->get['path'] . '_' . $result['category_id'] . $url)
                );
            }

и такой фрагмент чуть дальше:

PHP:

$data = array(
                'filter_category_id' => $category_id,
                'filter_filter'      => $filter,
                'sort'               => $sort,
                'order'              => $order,
                'start'              => ($page - 1) * $limit,
                'limit'              => $limit
            );

В той статье говориться о добавлении 'filter_sub_category' => true именно в последний фрагмент, где его изначально быть не должно. Если у вас он там был, значит у вас уже был модифицированный файл. И да, в этом месте эта строка действительно приводит к подтягиванию товаров из подкатегорий.