Нет, удаление, к сожалению, должен обеспечивать сам разработчик. Только с версии 2.0 будет добавлен "Менеджер модификаций" который позволяет это делать.
Ну хотя бы из админки можно ли как-то удалить хотя бы название неработающих(ненужных) модулей, что-бы глаза не мусолили?
Чтоб скрыть в админке неиспользуемые модули, нужно к файлам их контроллеров к расширению дописать знак подчёркивания - .php_ Контроллеры модулей здесь: /admin/controller/module
